碱性燃料电池（AFC）的周边系统包括：供气系统、电流收集器、排水系统、冷却系统、控制系统。
1、供气系统
由于在KOH电解质中CO:能形成碳酸盐，因而氢和氧化剂气体都不能含有高浓度的CO2,在实际使用中允许的Co,对电池堆有其他副作用的杂质也应消除。去除空气中0.03%的CO:可采用化学吸收法，大多数做法是使CO,气体三次通过吸收剂。常用的吸收剂有碱石灰、乙醇胺等。其他的CO2预处理方法有采用分子筛或Pd-Ag合金膜进行循环处理。
2、电流收集器
与其他类型燃料电池一样，电流收集可用单极或双极。这两种形式各有优缺点，哪个都不能成为AFC的特征。电化学能源公司在电池堆中使用了边缘收集，西门子则使用的是双极式，而美国宇宙飞船AFC采用的是双极•收集和边缘收集结合的方式。
3、排水系统
燃料电池过程产生的产物水必须不断地从电池堆中排出去，以使KOH的浓度保持在一定的范围内。根据不同的电极类型，排水也相应地有不同的方式。一种类型是以循环电解质携带水分并冷却电池堆.水的蒸发在电池堆外进行。另一种类型是通过反应气体循环排除水分。
4、冷却系统
在氢气一氧气AFC中.余热是相当大的。对于氢气一空气AFC，电化学能源公司有两种排热途径，空气和电解质。在这两种AFC中，电解质都必须通过热交换器。若电解质是固定型的，须在每间隔一定数量的电池(组)后，特别安装冷却系统，以带走电池堆的余热。
5、控制系统
整个燃料电池系统必须是能调整和控制的。必须有一个控制系统，它不仅可在正常状态下对燃料电池的启动、运行及停机等进行完全程序化的控制，而且能进行一定的干预以预防燃料电池及其附属系统出现异常和事故。